Datenanalyse und Softwareimplementierung

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auf Anfrage
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100€/Stunde
Nordrhein-Westfalen
31.10.2018

Kurzvorstellung

Molekularbiologin mit 15 Jahren Berufserfahrung im Bereich Bioinformatik im industriellen und wissenschaftlichen Umfeld.
Datenanalyse (u.a. multi-omics Daten), R-Programmierung, Projektmanagement, Implementierung und Einführung von Softwarelösungen

Ich biete

IT, Entwicklung
  • R (Programmiersprache)
  • TIBCO Spotfire
  • Data Mining
  • Reporting
  • Projektmanagement (IT)
  • Projektleitung / Teamleitung (IT)
Forschung, Wissenschaft, Bildung
  • Data Science
  • Biologie
  • F&E Management
Sprachen, Dienstleistung, Soziales
  • Projektmanagement - Softwaretool-Schulung

Projekt‐ & Berufserfahrung

Spotfire-Consultants
DB-Systel, Frankfurt aM
3/2014 – 6/2014 (4 Monate)
Logistikdienstleister
Tätigkeitszeitraum

3/2014 – 6/2014

Tätigkeitsbeschreibung

Spotfire Programmierung
Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
Integration von unterschiedlichen Daten (aus Datenfiles oder Datenbanken via SQL)
Datenkomprimierung und Datenvisualisierung (Listen, Ausgabe statistischer Werte, graphische Visualisierung wie Line-/Pie-/Barcharts, geogrphsiche Karten)
Datenanalysen: allgemeine statistische Auswertung
Aufarbeitung der Daten für die Darstellung via Webplayer
Präsentation von Projektergebnissen
Schulung in der Nutzung von TIBCO Spotfire

Eingesetzte Qualifikationen

TIBCO Spotfire, SQL, Statistik (allg.)


Projektleiter
Kenomx Data Solutions GmbH, Bonn
1/2014 – 12/2017 (4 Jahre)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

1/2014 – 12/2017

Tätigkeitsbeschreibung

Entwicklung und Implementierung eines Datenmanagementsystem für die Pflanzenzüchtung:
Projektmanagement
Erfassung und Dokumentation von Nutzeranforderungen, Pflichtenhefte
Koordinierung zwischen Kunde und Softwareentwickler
Einführung der entwickelten Systeme beim Kunden (Nutzerschulungen, allgemeiner Support)
Nutzerspezifische Erweiterung der Software auf basis von R

Eingesetzte Qualifikationen

R (Programmiersprache), PostgresSQL, Projektmanagement (IT), Rollout, Landtechnik / Agrartechnik, Statistik (allg.), Data Science


Team- und Projektleiter
Philip Morris Research Laboratories GmbH, Köln
2/2006 – 10/2011 (5 Jahre, 9 Monate)
Konsumgüterindustrie
Tätigkeitszeitraum

2/2006 – 10/2011

Tätigkeitsbeschreibung

Aufbau und Leitung des Teams Bioinformatik
Projektleitung für verschiedene Projekte
Entwicklung und Einführung eines wissenschaftlichen Datenmanagement Systems
Ausarbeiten und Durchführung von Software-Schulungen
Präsentation der Ergebnisse der Arbeitsgruppe
Etablierung und Automatisierung von Methoden für die Analyse von genomweiten Genexpressionsdaten, anderen `omics Daten und Sequenzdaten Daten aus Human- und Mausstudien
Entwicklung und Etablierung einer Software für die Modellierung von biologische Netzwerken
Arbeiten in einem internationalen, Standort-übergreifendem und englisch-sprachigem Team

Eingesetzte Qualifikationen

R (Programmiersprache), TIBCO Spotfire, Predictive analytics, Data Mining, Reporting, User Experience (UX), Softwareauswahl (Evaluierung)

Ausbildung

Biologie
(Diplo-Biologe)
Jahr: 1996
Ort: Giessen

Qualifikationen

Datenanalysen
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Definition von Use Cases
• Entwicklung und Implementierung von Analyseverfahren (u.a. Datennormalisierung, Regressionen, statistische Tests, Clusterverfahren, PCA, maschinelle Lernverfahren)
• Anwendung von Analyseverfahren auf diverse Datentypen
• Standardisierung und Dokumentation von Analyseverfahren

Entwicklung von Datenmanagement-/Softwarelösungen
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Definition von Use Cases
• Entwicklung von (relationalen) Datenmodellen
• Entwicklung von Software-Prototypen (in Zusammenarbeit mit Informatikern)
• Iterative Umsetzung der Nutzeranforderungen
• Validierung und Integration von heterogenen Daten
• Integration von externen Analysetools, z.B. R
• Standardisierung und Dokumentation von Arbeitsabläufen
• Dokumentation und Präsentation von Projektergebnissen
• Nutzerschulungen

Software Evaluierung
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Evaluierung möglicher Softwarelösungen
• Dokumentation der evaluierten Software, Darstellung der Vor- und Nachteile, Empfehlungen für einzelne Lösungen
• Einführung der Software mit Trainingseinheiten

Spotfire Programmierung/Reporting
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Integration von unterschiedlichen Daten (aus Datenfiles oder Datenbanken)
• Datenkomprimierung und Datenvisualisierung (Listen, Ausgabe statistischer Werte, graphische Visualisierung wie Line-/Pie-/Barcharts, Box-/Scatterplots, Heatmaps, Dendrogramme)
• Datenanalysen: Korrelationsanalysen, Clustering, allgemeine statistische Auswertung
• Aufarbeitung der Daten für die Darstellung via Webplayer
• Präsentation von Projektergebnissen
• Schulung in der Nutzung von TIBCO Spotfire

R-Programmierung
• Erfassung und Dokumentation der Nutzeranforderungen
• Implementierung von Analyse-, Visualisierungs- und Reportingfunktionen

Evaluierung öffentlich verfügbarer Daten
• Erfassung der internen Fragestellungen
• Datenbankrecherchen
• Zusammenstellung von relevanten Datenquellen oder einzelnen Datensätzen
• Integration proprietärer und öffentlich verfügbarer Daten
• Dokumentation der Ergebnisse

EDV-Kenntnisse
• R/Bioconductor: sehr gute Kenntnisse
• Analyse und Reporting Software wie Tibco Spotfire: sehr gute Kenntnisse
• Programme zur Analyse und Interpretation von multi-omics und SNP Daten: u.a. Tibco Spotfire, EMBOSS, Flapjack: sehr gute Kenntnisse
• Programme für die Modellierung biologischer und chemischer Netzwerke: Ingenuity Pathway Analysis, Genstruct Technology Platform, Cytoscape: sehr gute Kenntnisse
• Gen- und Protein-basierte Datenbanken: u.a. NCBI- und EBI-Datenbanken: sehr gute Kenntnisse
• KNIME/RapidMiner: Grundlagen Kenntnisse
• PERL Programmierung: gute Kenntnisse
• Linux/Unix Betriebssystem: gute Kenntnisse
• SQL: gute Kenntnisse
• Microsoft: MS Word, MS Excel, MS Powerpoint, MS Access: sehr gute Kenntnisse


Persönliche Daten

Sprache
  • Deutsch (Muttersprache)
  • Englisch (Fließend)
Reisebereitschaft
auf Anfrage
Arbeitserlaubnis
  • Europäische Union
Home-Office
bevorzugt
Profilaufrufe
557
Berufserfahrung
19 Jahre und 3 Monate (seit 08/1999)
Projektleitung
12 Jahre

Kontaktdaten

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