Physician Scientist / Arzt und Wissenschaftler / Data Science
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- 01.01.2024
Kurzvorstellung
Qualifikationen
Projekt‐ & Berufserfahrung
2/2023 – offen
Tätigkeitsbeschreibung
Wissenschaftler in der Proteomics Core Facility
Zusammenarbeit und gemeinsame Entwicklung wissenschaftlicher Projekte auf der Grundlage von LC-MS/MS-Proteomik
Probenvorbereitung, Massenspektrometriemessungen, Wartung von Massenspektrometern.
Spezialisiert auf die Datenanalyse von Hochdurchsatzdaten. Qualitätskontrolle, statistische Analyse und Erstellung von professionell aussehenden Abbildungen für wissenschaftliche Publikationen
Entwicklung eines R-Pakets für die Analyse von Hochdurchsatzdaten Entwicklung einer R Shiny-App für die GUI-gesteuerte Datenanalyse von Hochdurchsatzdaten
Grundlagenforschung, Medizinforschung, Biologie, Naturwissenschaft, Statistik (allg.), R (Programmiersprache), Scientific computing / wissenschaftliches Rechnen
5/2019 – 2/2020
Tätigkeitsbeschreibung
Mitarbeiter in Projekten zum Einfluss von Proteasen im Tumormikromilieu bei der Karzinogenese unter Anwendung von Hochdurchsatzmethoden
Projektentwicklung und Konzeption von Experimenten
Projektleitung
Datenanalyse und Statistik
Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse in lokalen Seminaren und auf internationalen Konferenzen
Zusammenfassung von wissenschaftlichen Ergebnissen in Publikationen
Umfangreiche praktische Erfahrung mit massenspektrometriebasierten Methoden, einschließlich Probenahme, Probenvorbereitung, Datenanalyse und Statistik, sowie Hochdurchsatzdaten
Umfangreiche Erfahrung in molekularbiologischen Methoden, biochemischen Methoden, Histologie, u.a.
Gute Kenntnisse über In-vivo-Experimente an Mäusen
Medizinforschung, Humanmedizin, Onkologie, Biologie, Statistik (allg.), R (Programmiersprache)
7/2018 – 12/2018
Tätigkeitsbeschreibung
Mitarbeiter in Projekten zum Einfluss von Proteasen im Tumormikromilieu bei der Karzinogenese unter Anwendung von Hochdurchsatzmethoden
Projektentwicklung und Konzeption von Experimenten
Projektleitung
Datenanalyse und Statistik
Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse in lokalen Seminaren und auf internationalen Konferenzen
Zusammenfassung von wissenschaftlichen Ergebnissen in Publikationen
Umfangreiche praktische Erfahrung mit massenspektrometriebasierten Methoden, einschließlich Probenahme, Probenvorbereitung, Datenanalyse und Statistik, sowie Hochdurchsatzdaten
Umfangreiche Erfahrung in molekularbiologischen Methoden, biochemischen Methoden, Histologie, u.a.
Gute Kenntnisse über In-vivo-Experimente an Mäusen
Biologie, Humanmedizin, Medizinforschung, Onkologie, R (Programmiersprache), Statistik (allg.)
12/2016 – 6/2018
Tätigkeitsbeschreibung
Mitarbeiter in Projekten zum Einfluss von Proteasen im Tumormikromilieu bei der Karzinogenese unter Anwendung von Hochdurchsatzmethoden
Projektentwicklung und Konzeption von Experimenten
Projektleitung
Datenanalyse und Statistik
Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse in lokalen Seminaren und auf internationalen Konferenzen
Zusammenfassung von wissenschaftlichen Ergebnissen in Publikationen
Umfangreiche praktische Erfahrung mit massenspektrometriebasierten Methoden, einschließlich Probenahme, Probenvorbereitung, Datenanalyse und Statistik, sowie Hochdurchsatzdaten
Umfangreiche Erfahrung in molekularbiologischen Methoden, biochemischen Methoden, Histologie, u.a.
Gute Kenntnisse über In-vivo-Experimente an Mäusen
Betreuung von Studenten
Biologie, Humanmedizin, Medizinforschung, Onkologie, R (Programmiersprache), Statistik (allg.)
1/2012 – 11/2016
Tätigkeitsbeschreibung
Mitarbeiter in Projekten zum Einfluss von Proteasen im Tumormikromilieu bei der Karzinogenese unter Anwendung von Hochdurchsatzmethoden
Projektentwicklung und Konzeption von Experimenten
Projektleitung
Datenanalyse und Statistik
Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse in lokalen Seminaren und auf internationalen Konferenzen
Zusammenfassung von wissenschaftlichen Ergebnissen in Publikationen
Umfangreiche praktische Erfahrung mit massenspektrometriebasierten Methoden, einschließlich Probenahme, Probenvorbereitung, Datenanalyse und Statistik, sowie Hochdurchsatzdaten
Umfangreiche Erfahrung in molekularbiologischen Methoden, biochemischen Methoden, Histologie, u.a.
Gute Kenntnisse über In-vivo-Experimente an Mäusen
Betreuung von Bachelor- und Masterstudenten
Biologie, Humanmedizin, Medizinforschung, Onkologie, R (Programmiersprache), Statistik (allg.)
7/2009 – 10/2009
Tätigkeitsbeschreibung
Projekt: Krebsmortalität Atlas von Kolumbien
Systematische Literaturrecherche zu Krebsmortalitätsraten und Inzidenzraten und Zusammenfassung der Ergebnisse
Hämatologie, Humanmedizin, Medizinforschung, Onkologie, R (Programmiersprache), Statistik (allg.)
4/2009 – 9/2009
Tätigkeitsbeschreibung
Projekt: "The SUPPORT Collaboration: Supporting Policy Relevant Reviews and Trials"
Entwicklung von medizinischen Zusammenfassungen für politische Entscheidungsträger, von medizinischen Maßnahmen, die nützlich sind, um die Gesundheit von Müttern und Kindern in Ländern mit niedrigem und mittlerem Einkommen zu verbessern.
Systemische Literaturrecherche von klinischen Studien
Zusammenfassung der klinischen Studie und systematische Übersichtsarbeiten in Laiensprache
Gynäkologie, Humanmedizin, Kindermedizin, Medizinforschung, Statistik (allg.)
1/2009 – 10/2009
Tätigkeitsbeschreibung
Projekt: "Risikomanagementmodell für Brustkrebs für Kolumbien"
Literaturübersicht über Brustkrebs von der Vorsorge bis zur Behandlung
Entwicklung von Screening- und Behandlungsfließbildern auf der Grundlage der Literatur zur Erstellung eines Risikomanagementmodells für Brustkrebs
Humanmedizin, Onkologie, Statistik (allg.)
1/2007 – 3/2009
Tätigkeitsbeschreibung
Forscher der systematischen Übersichtsarbeit für The Cochrane
Collaboration: "Pneumokokken-Impfstoffe zur Vorbeugung von Streptococcus pneumoniae bei Patienten nach Chemotherapie und/oder Strahlentherapie"
Koordinator und Co-Investigator des Projekts: "Vorsorgeuntersuchung auf Prostatakrebs - Klinische Praxisleitlinie"
Mitbearbeiter des Projekts: "PET/CT Klinische Protokolle für die Diagnose und das Management ausgewählter Krebsarten"
Assistent im Projekt: "Leitlinien für die klinische Praxis, Expertenkonsens und medizinische Protokolle"
R (Programmiersprache), Hämatologie, Humanmedizin, Medizinforschung, Onkologie, Statistik (allg.)
Ausbildung
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Universidad de Buenos Aires / Albert-Ludwigs-Unive
Universidad Javeriana, Bogotá, Kolumbien
Über mich
Neben meiner klinischen und labortechnischen Erfahrung verfüge ich auch über umfangreiche Erfahrung in der experimentellen Konzeption von klinischen und biologischen Studien und über fundierte Kenntnisse in der Datenanalyse und Statistik. Ergänzend dazu habe ich auch große Erfahrung in der Verwendung von R/R-Programmierung, und Shiny-App-Entwicklung für die Datenanalyse und die Erstellung von wissenschafltichen Grafiken.
Weitere Kenntnisse
Datenanalyse
Fundierte Kenntnis von Linux, Windows, MS Office, RStudio, ImageJ, OriginPro, JMP
Programmierung in R, Shiny-App-Entwicklung, HTML, und Grundkenntnis von Python
Molekular Medizin
Molekular Onkologie
Wissenschaftliches Schreiben und Veröffentlichungen
Wissenschaftliche Vorträge
Persönliche Daten
- Spanisch (Muttersprache)
- Deutsch (Fließend)
- Englisch (Fließend)
- Europäische Union
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