freiberufler Data Science und Engineering. Bioinformatik auf freelance.de

Data Science und Engineering. Bioinformatik

offline
  • 85‐94€/Stunde
  • 13359 Mitte
  • DACH-Region
  • de  |  en  |  es
  • 02.01.2022

Kurzvorstellung

Ich bin Data Scientist mit Hintergrund in Bioinformatik und Arbeitserfahrung in Start-up Unternehmen und Forschungszentren.
Daher eine diverse Projekterfahrung von Marketing, NPS score improvement bis Biomarker prediction.

Auszug Referenzen (1)

"E. T. provided a great support to our data retrieval team and managed the signal management system Empirica Signal."
Data Scientist Consultant
Heiko Marzahn
Tätigkeitszeitraum

5/2020 – 2/2021

Tätigkeitsbeschreibung

Expert as well as technical consultancy for the provision of the results of the safety databases of various customers within the Merck Pharmacovigilance system.
Covering an the environment of "SQL", "SQL/PLSQL", "IBM Cognos Analytics" and "Spotfire".
Additional Subject Matter Expert in the Oracle Empirica Pharmacovigilance Signal Management application.

- Content translation of the existing requirements of external customers (physicians as well as operative units)
and members of the IT team

- Development and collection of the medical and scientific questions of the "Safety Data Retrieval Team" within the interviews with the team and translation of the questions into technical requirements for the database.

search strategies
- Programming new and improving existing complex SQL statements
- Development of innovative methods for analysis, evaluation and presentation of pharmacovigilance data
(ARISg, Argus Safety).
- Optimization of query operations by creating and quality checking the database output of the reporting and visualization software.

The aim of the activity is to achieve measurable improvements by automating and optimizing existing processes and tools.

Translating stakeholder requirements into validated systems.

Eingesetzte Qualifikationen

Data Mining, IBM Cognos, PL/SQL, Qualitätsmanagement / QS / QA (IT), Signalverarbeitung

Ich biete

  • Big Data
  • Data Mining
  • Data Science
  • Datawarehouse / DWH
  • Datenanalyse
  • Datenbankadministration
  • Natural Language Processing (NLP)
  • Python
  • Statistik (allg.)
  • TensorFlow

Projekt‐ & Berufserfahrung

Data Scientist Consultant
Merck KGaA, Darmstadt
5/2020 – 2/2021 (10 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

5/2020 – 2/2021

Tätigkeitsbeschreibung

Expert as well as technical consultancy for the provision of the results of the safety databases of various customers within the Merck Pharmacovigilance system.
Covering an the environment of "SQL", "SQL/PLSQL", "IBM Cognos Analytics" and "Spotfire".
Additional Subject Matter Expert in the Oracle Empirica Pharmacovigilance Signal Management application.

- Content translation of the existing requirements of external customers (physicians as well as operative units)
and members of the IT team

- Development and collection of the medical and scientific questions of the "Safety Data Retrieval Team" within the interviews with the team and translation of the questions into technical requirements for the database.

search strategies
- Programming new and improving existing complex SQL statements
- Development of innovative methods for analysis, evaluation and presentation of pharmacovigilance data
(ARISg, Argus Safety).
- Optimization of query operations by creating and quality checking the database output of the reporting and visualization software.

The aim of the activity is to achieve measurable improvements by automating and optimizing existing processes and tools.

Translating stakeholder requirements into validated systems.

Eingesetzte Qualifikationen

Data Mining, IBM Cognos, PL/SQL, Qualitätsmanagement / QS / QA (IT), Signalverarbeitung

Data Scientist
Kundenname anonymisiert, Berlin
1/2020 – 3/2020 (3 Monate)
IT & Entwicklung
Tätigkeitszeitraum

1/2020 – 3/2020

Tätigkeitsbeschreibung

Implementierung einer Recommendationengine basierend auf vorhandenen Bild und verkaufsdaten.
Der Ansatz basiert auf der Walmart implementation via imagenet based quantitiative preprocessing. 

Eingesetzte Qualifikationen

Data Science, Data Mining, TensorFlow, Python

Data Scientist (Festanstellung)
AMBOSS, Berlin
5/2018 – 1/2020 (1 Jahr, 9 Monate)
IT & Entwicklung
Tätigkeitszeitraum

5/2018 – 1/2020

Tätigkeitsbeschreibung

Design und Aufbau einer Elasticsearch Search Engine.
Volltext Content-Suchmaschine für semi-intelligente Useranfragen. Auswertung mittels Text
crosslinking. Data Design und Technische Implementierung als Microservice. Inklusive ETL.
-> Verbesserte Exposition bestehenden Materials, increases NPS score

Implementierung einer Real-time Userperformance Analyse.
Statistische Auswertung von User sessions mit < 0.2 Sekunden delay
-> Verbesserte User interaktion

Statistische Vorhersagen von Userverhalten / Scoring.
Design eines Scoring systems zur vorhersage von realen Testergebnissen ohne vorhandene
Trainingsdaten.
-> Marketingpush mit hoher Organic-Social Marktwirkung.

Sentimentanalyse, AMBOSS.
Klassifikation von eingehenden Userkommentaren mittels Tensorflow.
-> Entlastung des Servicepersonals.

ETL Design / Airflow.
Design von ETL skripten zur Datenaufbereitung und Qualitätskontrolle.
-> Ein verbesserter Datenfluss spart mittelfristig Zeit und Geld

Eingesetzte Qualifikationen

Data Science, Statistik (allg.), Data Mining, Datawarehouse / DWH, Deeplearning4j, Python

Data Scientist Bioinformatiker Forschung (Festanstellung)
CRG Barcelona, Barcelona
11/2013 – 11/2017 (4 Jahre, 1 Monat)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

11/2013 – 11/2017

Tätigkeitsbeschreibung

Forschung in der Bioinformatik
NGS Data analysis
Datawarehousing
Algorythmic development ( Java and Python )
Deep Learning on Genomics
Statistical Analysis

Eingesetzte Qualifikationen

Data Science, Big Data, Machinelles Lernen (allg.)

Bioinformatiker (Festanstellung)
Kundenname anonymisiert, Wien
2/2013 – 10/2013 (9 Monate)
Life Sciences
Tätigkeitszeitraum

2/2013 – 10/2013

Tätigkeitsbeschreibung

Analysis of NGS data - assembly and alignment,
Annotation of bacterial genomes,
Implementation of a data warehouse solution (Intermine) and
Analysis of proteomics and transcriptomics data

Eingesetzte Qualifikationen

Data Mining, Datawarehouse / DWH

Ausbildung

Doktorat Bioinformatik
(Cum Laude)
Jahr: 2017
Ort: Barcelona, Spanien
Master Biotechnologie
(Ausgezeichneter Erfolg)
Jahr: 2013
Ort: BOKU, Wien / NUI Galway
Bakkalaureat Biotechnologie
(Guter Erfolg)
Jahr: 2011
Ort: BOKU, Wien
BORG / Gymnasium
(Ausbildung)
Jahr: 2005
Ort: Feldkirch, Austria

Qualifikationen

Promotion Bioinformatik / Big Data
Python / Java / SQL
BigQuery / Data Warehousing / Airflow / Jenkins / Kubernetes / Docker
Lehrerfahrung in Biostatistik

Über mich

Ich bin erst vor kurzem in die Freiberuflichkeit gestartet.
Meine bisherige Erfahrung teilt sich zwischen Kleinunternehmen in medizinischem e-learning Umfeld sowie Forschung in Forschungszentren und großen Pharmaunternehmen ( CLC-Bio / Qiagen ).

Persönliche Daten

Sprache
  • Deutsch (Muttersprache)
  • Englisch (Fließend)
  • Spanisch (Gut)
Reisebereitschaft
DACH-Region
Arbeitserlaubnis
  • Europäische Union
Profilaufrufe
1694
Alter
35
Berufserfahrung
9 Jahre und 3 Monate (seit 10/2012)

Kontaktdaten

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