Medical Data Scientist | Medizin-Informatikerin und Ärztin mit Schwerpunkt Data Science in der Gesundheitsversorgung
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- 21.04.2024
Kurzvorstellung
Entwicklung von Projekten zur Erschließung und Analyse von Gesundheitsdaten - von der Konzeption bis hin zur Implementierung.
Qualifikationen
Projekt‐ & Berufserfahrung
12/2023 – offen
Tätigkeitsbeschreibung
• Beratung bzgl. der Datengewinnung aus Arztinformationssystemen
• Erstellen von Datensatzbeschreibungen und Datenvalidierungen, Anforderungsanalyse anhand von Dokumentationen zum Datentransfer der Kassenärztlichen Bundesvereinigung (KBV)
• Aufbereitung von Inhalten für ein fachfremdes Publikum
Gesundheitswesen, IT-Beratung (allg.)
10/2023 – 11/2023
Tätigkeitsbeschreibung
• Forschung und Experimente mit aktuellen Deep Learning Verfahren basierend auf Large Language Models (LLM)
• Recherche und Testen von geeigneten deutschsprachigen Modellen
• Prompt design
• Evaluation zum Umgang mit token limits von LLMs
• Identifikation von Datenquellen für ein Finetuning bzw. zur Evaluation des Modells und Aufbereitung von Datensätzen
Technologien: Python (u.a. Pakete pandas, transformers, langchain, llama-cpp-python, difflib), llama.cpp framework, Linux-Betriebssystem
Natural Language Processing (NLP), Python
9/2022 – 6/2023
Tätigkeitsbeschreibung
- Entwicklung und fachliche Leitung des Projektes
- Konzeption und Programmierung von Data Pipelines zur Datenbankabfrage, Datenaufbereitung, -anreicherung und -export (Data Engineering).
- Transformation des dokumentenbasierten Datenformats in ein firmenexternes Datenformat zur Strukturierung von Gesundheitsdaten
- Evaluierung und Integration von Quellen zur Erschließung neuer Daten und Anreicherung von Daten zur Steigerung des Erkenntnisgewinns
Technologien: Elasticsearch, Python (u.a. Pakete pandas, elasticsearch-dsl)
Data Science, elasticSearch, ETL, Python
5/2022 – 6/2023
Tätigkeitsbeschreibung
- Entwicklung und fachliche Leitung des Projektes
- Analyse und Weiterentwicklung von fachlichen medizinischen Anforderungen und Erarbeitung von technischen Lösungen
- Design und Programmierung von Data Pipelines zur Datentransformation und -vorverarbeitung sowie zum Datentransfer. Integration von Daten aus mehreren Quellen.
- Datenprüfung und -bereinigung zur Sicherstellung der Qualität und der medizinischen Plausibilität der Daten
- Entwurf und Umsetzung eines relationalen Datenbankschemas, Erstellung der zugehörigen Dokumentationen
- Auswertungen
- Fachliche Beratung und Vertretung in Kunden- sowie Expertengesprächen
- Präsentationen vor Kunden und Fachpublikum
- Durchführung von Schulungen und Erstellen von Schulungsunterlagen
Technologien: Elasticsearch, Python (u.a. Pakete pandas, numpy, elasticsearch_dsl)
elasticSearch, Data Science, Datenbankentwicklung, Medizin, Python
3/2022 – 6/2023
Tätigkeitsbeschreibung
Projekt zur Bereitstellung einer Forschungsdatenbank für eine medizinische Studie
Tätigkeitszeitraum: 05/2022 – 06/2023
Tätigkeitsbeschreibung:
- Entwicklung und fachliche Leitung des Projektes
- Analyse und Weiterentwicklung von fachlichen medizinischen Anforderungen und Erarbeitung von technischen Lösungen
- Design und Programmierung von Data Pipelines zur Datentransformation und -vorverarbeitung sowie zum Datentransfer. Integration von Daten aus mehreren Quellen.
- Datenprüfung und -bereinigung zur Sicherstellung der Qualität und der medizinischen Plausibilität der Daten
- Entwurf und Umsetzung eines relationalen Datenbankschemas, Erstellung der zugehörigen Dokumentationen
- Auswertungen
- Fachliche Beratung und Vertretung in Kunden- sowie Expertengesprächen
- Präsentationen vor Kunden und Fachpublikum
- Durchführung von Schulungen und Erstellen von Schulungsunterlagen
Technologien: Elasticsearch, Python (u.a. Pakete pandas, numpy, elasticsearch_dsl)
Projekt zur Datentransformation und -export in ein Format zur Strukturierung von Gesundheitsdaten
Tätigkeitszeitraum: 09/2022 – 06/2023
Tätigkeitsbeschreibung:
- Entwicklung und fachliche Leitung des Projektes
- Konzeption und Programmierung von Data Pipelines zur Datenbankabfrage, Datenaufbereitung, -anreicherung und -export (Data Engineering).
- Transformation des dokumentenbasierten Datenformats in ein firmenexternes Datenformat zur Strukturierung von Gesundheitsdaten
- Evaluierung und Integration von Quellen zur Erschließung neuer Daten und Anreicherung von Daten zur Steigerung des Erkenntnisgewinns
Technologien: Elasticsearch, Python (u.a. Pakete pandas, elasticsearch-dsl)
weitere Tätigkeiten: Beratung u. Qualitätssicherung bzgl. Datengewinnung aus elektronischen Patientenakten. Anforderungsanalyse anhand von Datenaustauschformaten zum Labordatentransfer der KBV. Datenanomaliedetektionen.
Data Science, Datenanalyse, Datenbankentwicklung, Datenmodellierung, Datenpflege / -erfassung, ETL, Python
8/2021 – 2/2022
Tätigkeitsbeschreibung
- Programmierung eines R-Pakets zur Automatisierung von Datenbankabfragen eines OLAP-Cubes in MDX, Datenvalidierungen und Reporterstellungen.
- Anforderungsanalyse und -dokumentation
- Design und Programmierung der Funktionen inkl. Dokumentation und Tests. Versionskontrolle mit Git.
Technologien: R, MDX, Git
Datenanalyse, Multidimensional Expressions (MDX), Online Analytical Processing (OLAP), R (Programmiersprache)
5/2020 – 7/2020
Tätigkeitsbeschreibung
- Erstellung eines Klassifikationsmodells zur automatischen Analyse der Themen der Klinikberichte und Bewertung jener Themen: Topic Classification und Sentiment Analysis
- Datenaufbereitung und Einsatz von Techniken des Machine Learning: Natural Language Processing und Deep Learning (neuronale Netzwerke)
Technologien: Python (u.a. Einsatz der Bibliotheken keras, nltk, numpy, scikit-learn)
weitere Tätigkeiten: Erstellung einer Datenschutzfolgenabschätzung (DSFA) nach dem Standard-Datenschutzmodell (SDM). Statistische Auswertung und Visualisierung der Patientenzufriedenheit anhand von Sternebewertungen, u.a. Einsatz der Pakete pandas, numpy, matplotlib, seaborn.
Data Science, Maschinelles Lernen, Neuronale Netze, Natural Language Processing (NLP), Python
Ausbildung
Berliner Hochschule für Technik
Berlin
Universität Düsseldorf
Düsseldorf
Universität Düsseldorf
Düsseldorf
Über mich
- gewissenhaftes Arbeiten und hohes Qualitätsbewusstsein
- Zuverlässigkeit
- flexibel einsetzbar - schnelle Auffassungsgabe und schnelles Einarbeiten in verschiedensten Themengebiete
- gute interdisziplinäre Kommunikationsfähigkeiten
Weitere Kenntnisse
Projekte mit Schnittstelle Medizin - Informatik
- Fachliche Leitung und Entwicklung von datenbasierten Projekten
- Analyse und Weiterentwicklung von fachlichen medizinischen Anforderungen und Erarbeitung von technischen Lösungen (Konzeption, Proof of Concept sowie Implementierung)
- Einbringen von interdisziplinärer Expertise bei der Planung und Durchführung der Projekte
- Professionelle fachliche Beratung
- Kommunikation mit internen und externen Stakeholdern
- Unterstützung bei der Erarbeitung von Use Cases
Analyse von Gesundheitsdaten
- Durchführung von explorativen und deskriptiven Analysen auf Grundlage von z.B. klinischen Daten, elektronischen Patientenakten, Patientendaten aus der Versorgungsforschung, Studiendaten
- Interpretation der Ergebnisse, Präsentation und Visualisierung der Erkenntnisse an Stakeholder
- Statistische Auswertungen und Erstellen von Reports
Evaluierung und Integration von Quellen zur Erschließung neuer Daten und Anreicherung von Daten zur Steigerung des Erkenntnisgewinns
Identifikation und Evaluierung von Möglichkeiten zur Verbesserung der Datenqualität
- Datenprüfung und -bereinigung zur Sicherstellung der Qualität und der medizinischen Plausibilität der Daten
Programmierung von Skripten zur Automatisierung von Datenprozessen
- Design und Programmierung von Data Pipelines / ETL-Prozessen zur Datenintegration (Datentransfer und Datentransformation)
Design und Abfrage von Datenbanken
- Entwurf von Datenbankschemata und Erstellen der zugehörigen Dokumentationen
- Arbeit mit relationalen Datenbanken (SQL) und NoSQL-Datenbanken (Elasticsearch)
- Umsetzung von komplexen Datenbankabfragen
Kommunikation von Fach- und Projektinhalten an unterschiedliche Zielgruppen
- Wissensvermittlung und Präsentationen für Fachpublikum sowie Fachfremde
- Schulung von Fachfremden hinsichtlich medizinischer und medizininformatischer Themen
- Erstellen von Schulungsunterlagen
Weitere Tätigkeitsgebiete / Technologien auf Wunsch und nach Vorbereitung möglich
Persönliche Daten
- Deutsch (Muttersprache)
- Englisch (Fließend)
- Spanisch (Gut)
- Französisch (Gut)
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