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Data Scientist und Bioinformatiker

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  • 125‐135€/Stunde
  • 81243 München
  • auf Anfrage
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  • 13.04.2026

Kurzvorstellung

Ich bin ein erfahrener Data Scientist und Bioinformatiker mit umfangreicher Erfahrung in der Softwareentwicklung in verschiedenen Programmiersprachen, mit umfangreichen Cloud- und KI-Kenntnissen sowie Teamleiter und Projektleitererfahrung.

Qualifikationen

  • C#5 J.
  • C# Developer
  • Cloud Computing mit Docker und Kubernetes
  • Java Database Connectivity
  • ML (z.B. Neuronale Netze, XGBoost), KI-Workflows
  • Postgresql2 J.
  • Python9 J.
  • R (Programmiersprache)15 J.
  • SQL (PostgreSQL, MySQL, T-SQL)
  • TypeScript/JavaScript (Node.js)

Projekt‐ & Berufserfahrung

Berater für Bioinformatik / Leitender Bioinformatiker
Alchemy Bio
3/2025 – 11/2025 (9 Monate)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

3/2025 – 11/2025

Tätigkeitsbeschreibung

Durchführung biostatistischer Analysen in Python und R mit Schwerpunkt auf Multi-Omics-Datenanalyse in Human- und Mausgenomen. Entwicklung von Qualitätssicherungssystemen für diverse Datensätze und Automatisierung analytischer Pipelines in Python. Erstellung von FastAPIs für verschiedene Bioinformatik-Tools und KI-Workflows.

Eingesetzte Qualifikationen

Python, R (Programmiersprache)

Senior Scientist Bioinformatics
MOLEQLAR Analytics GmbH
5/2024 – 12/2024 (8 Monate)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

5/2024 – 12/2024

Tätigkeitsbeschreibung

Entwicklung einer Python-Anwendung zur Handhabung von Probeninformationen über GET/POST-APIs, Integration von JSON-Daten in eine extern gehostete SQL-Datenbank. Entwicklung eines statistischen Frameworks zur inkrementellen Verarbeitung von LC-MS-Daten und Automatisierung der gesamten Datenanalyse in Python.

Eingesetzte Qualifikationen

Python, SQL, Immobilienspezialist

Senior Bioinformatiker
PreOmics GmbH, Planegg
8/2021 – 3/2024 (2 Jahre, 8 Monate)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

8/2021 – 3/2024

Tätigkeitsbeschreibung

Gründung und Leitung der Bioinformatik-Gruppe. Aufbau automatisierter LC-MS-Pipelines in Python und C#. Entwicklung von Algorithmen und automatisierten Workflows in Python für die LC-MS-Datenverarbeitung und -analyse. Vergleich verschiedener DIA-Softwarelösungen und Entwicklung von Python-Programmen zur Arbeit mit diesen. Erstellung einer Django-Webanwendung mit PostgreSQL-Datenbankverbindung zur Erleichterung der LC-MS-Dateneingabe und -suche durch Experimentatoren.

Eingesetzte Qualifikationen

Python, C#, Immobilienspezialist, Django, Postgresql

Senior Scientist Bioinformatics
Leukocare AG, Planegg
9/2018 – 7/2021 (2 Jahre, 11 Monate)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

9/2018 – 7/2021

Tätigkeitsbeschreibung

Gründung und Leitung des Bioinformatik-Expertenteams. Entwicklung eines Deep-Learning-Algorithmus zur Vorhersage optimaler stabilisierender Formulierungen für Wirkstoffe. Entwicklung einer SQL-Datenbank für Wirkstoffe und Arzneimittel mit einer Webschnittstelle in C#. Entwicklung eines Algorithmus in Python zur Ableitung von Meta-Features von Proteinen für den Formulierungsvorhersagealgorithmus.

Eingesetzte Qualifikationen

C#, Python, SQL

Senior Bioinformatics Expert
Intomics A/S, Lyngby
10/2015 – 12/2017 (2 Jahre, 3 Monate)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

10/2015 – 12/2017

Tätigkeitsbeschreibung

Leitung und Beitrag zu mehreren pharmazeutischen Projekten mit Schwerpunkt auf Biomarker-Bewertung unter Verwendung von Microarrays, Next-Generation-Sequenzierung, Pfad- und Protein-Protein-Interaktionsanalysen. Entwicklung von Programmen in Java, Python, Perl und R mit Bioconductor-Paketen und Verwendung von Cytoscape.

Eingesetzte Qualifikationen

Linux-Systemadministrator, Python, Perl, R (Programmiersprache)

Staff Scientist Bioinformatics
Max Planck Institute for Developmental Biology
10/2003 – 9/2015 (12 Jahre)
nicht angegeben
Tätigkeitszeitraum

10/2003 – 9/2015

Tätigkeitsbeschreibung

Beitrag zu mehreren Genomik- und Transkriptomik-Projekten über verschiedene Modellorganismen. Entwicklung von Programmen in Java, Perl, C++ und R in Verbindung mit Bioconductor-Paketen für statistische Analysen und Visualisierung der analysierten Daten. Entwicklung einer Enterprise JavaBeans-Anwendung mit JavaServer Faces als Framework und einer zugrundeliegenden MySQL-Datenbank.

Eingesetzte Qualifikationen

Linux-Systemadministrator, Perl, C++, R (Programmiersprache), Enterprise Javabeans, Mysql

Ausbildung

Max Born Institute and Humboldt-Universität zu Berlin
Dr. rer. nat. (PhD in ultra short spectroscopy and laser physics)
1997
Berlin
Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
Diplomphysiker (graduate physicist)
1992
Heidelberg

Über mich

Erfahrener Data Scientist mit umfassenden Kenntnisen der Softwareentwicklung und dem Softwareengeering. Beherrschung mehrerer Programmiersprachen: Python (einschließlich FastAPI, Django), R (einschließlich Bioconductor), C#, Java, Typescript, JavaScript (einschließlich Node.js), Perl, PHP, Shell-Programmierung (Bourne Shell), PowerShell-Programmierung. Agiles Arbeiten mit Scrum (GitLab und GitHub) und Git als Version Control System. Bestens vertraut mit Cloud Computing (AWS) zusammen mit Docker und Kubernetes) und der Erstellung sowie Programmierung von KI-Workflows. Umfangreiche Kenntnisse in Machine Learning (Neuronale Netze / Deep Learning, XGBoost, Random Forests, Decission Trees). Arbeitete in verschiedenen Rollen in Deutschland, Dänemark und den Vereinigten Staaten und trug zu zahlreichen Projekten mit der Hauptverantwortung der Entwicklung von Algorithmen und deren Umsetzung in Source Code. Ergebnisorientiert mit langjähriger Erfahrung in Team- und Projektleitung. Softskills: Klare Kommunikation, Mentoring und Wertelegung auf Zwischenmenschlichkeit; legt Wert auf Augenhöhe gegenüber Mitarbeitern und Kollegen sowie Vorgesetzten.

Persönliche Daten

Sprache
  • Deutsch (Muttersprache)
  • Englisch (Fließend)
  • Französisch (Gut)
  • Spanisch (Gut)
  • Dänisch (Gut)
Reisebereitschaft
auf Anfrage
Arbeitserlaubnis
  • Europäische Union
Profilaufrufe
140
Berufserfahrung
1 Jahr und 7 Monate (seit 03/2025)
Projektleitung
1 Jahr

Kontaktdaten

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